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全式金助力天津科技大學研究登上PNAS雜志

 纖毛(也稱為鞭毛)是突出于真核細胞表面的一類細胞器,由纖毛膜、軸絲和基底部的基體組成,負責感受外界刺激(如光、聲、味、機械力和各類化學分子等)并將這些胞外信號傳導到胞內(nèi),細胞對這些信息進行應答。研究表明定位于細胞膜的許多重要的信號分子包括G蛋白偶聯(lián)受體、離子通道以及其他類型的信號蛋白均特異性定位于纖毛膜,這是決定纖毛進行信息傳遞的分子基礎(chǔ)。目前已知,纖毛信號分子通過與分子動力蛋白(motor proteins)驅(qū)動的鞭毛內(nèi)運輸體(intraflagellar transport(IFT)train)進行偶聯(lián),從而使其得以沿著纖毛微管軸突在細胞膜和纖毛膜之間動態(tài)運動。纖毛信號分子在纖毛膜和細胞膜之間循環(huán)運輸過程中,由八種保守蛋白(BBS1/2/4/5/7/8/9/18)組成的蛋白復合物BBSome在纖毛信號分子和鞭毛內(nèi)運輸體之間充當連接體(adaptor),其功能就是把纖毛信號分子偶聯(lián)到鞭毛內(nèi)運輸體從而使其得以依賴于IFT在纖毛膜和細胞膜間進行動態(tài)運送。因此,能夠?qū)е翨BSome組分缺失、組裝缺陷或纖毛定位異常的基因突變,均可引發(fā)纖毛信號分子在纖毛膜內(nèi)異常缺失或積累,從而導致巴德-畢德氏綜合癥(Bardet-Biedl syndrome,BBS)。亮氨酸拉鏈轉(zhuǎn)錄因子1 (LZTFL1) 可通過控制BBSome的含量來介導纖毛信號,是迄今為止發(fā)現(xiàn)的第17個與BBS有關(guān)的基因,LZTFL1基因突變會引發(fā)惡性腫瘤,繼而發(fā)展為癌癥。然而,迄今為止,這一過程背后的機制仍不明確。

 2021年8月26日,PNAS在線發(fā)表了天津科技大學樊振川團隊完成的題為Chlamydomonas LZTFL1 mediates phototaxis via controlling BBSome recruitment to the basal body and its reassembly at the ciliary tip的研究論文。全式金生物參與了該項研究,完成了RNA-seq等相關(guān)實驗環(huán)節(jié),在該項研究中發(fā)揮了重要作用。該研究以萊茵衣藻為模式生物,利用遺傳、生化、細胞和單分子體內(nèi)活體成像及RNA測序分析等技術(shù),闡明了LZTFL1通過調(diào)控BBSome向基底和纖毛尖端的重組來維持BBSome的纖毛動力學。



 這項研究的主要發(fā)現(xiàn)歸納為:1) 低濃度的LZTFL1在纖毛基底聚集;2)LZTFL1在纖毛中擴散,并在纖毛尖端與IFT分離的BBSome結(jié)合;3)LZTFL1促進BBSome進入纖毛;4)LZTFL1通過BBS3將BBSome送到基體;5)LZTFL1是穩(wěn)定IFT25/27所必需的;6)IFT25/27促進了在纖毛尖端的BBSome重新組裝;7)LZTFL1是一種趨光性的正調(diào)節(jié)因子,當纖毛中BBSome的異常積累或丟失,會破壞了纖毛BBSome的動力學,從而阻止了萊茵衣藻的趨光性。其中,在證明LZTFL1能穩(wěn)定IFT25/27的實驗中,發(fā)現(xiàn)天然LZTFL1和LZTFL1::YFP均存在于細胞質(zhì)中,這與LZTFL1從細胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到細胞核來抑制IFT25/27的轉(zhuǎn)錄的假設(shè)相反。因此,全式金生物利用RNA-seq分析,比較CC-125和LZTFL1miRNA細胞中mRNAs的表達,發(fā)現(xiàn)在LZTFL1miRNA細胞中,有234個基因表達出現(xiàn)上調(diào),422個基因表達出現(xiàn)下調(diào)(圖A),22個IFT蛋白mRNA保持在WT水平(圖B)。接著通過qPCR分析了LZTFL1miRNA細胞中IFT25、IFT27、IFT22、IFT46、IFT70、IFT38、IFT57、IFT43和IFT139的mRNA水平,發(fā)現(xiàn)它們均處于WT水平,表明除了IFT25/27外,LZTFL1不影響其他IFT的mRNA含量。


CC-125和LZTFL1miRNA細胞中轉(zhuǎn)錄水平差異分析


 全式金核酸純化系列產(chǎn)品TransZol Up Plus RNA Kit(ER501)與二代測序系列產(chǎn)品 MagicPure? RNA Beads (EC501)、TransNGS? RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina? (KP601)攜手助力該項研究,這也是全式金首次以合作者的身份登上PNAS雜志。

 全式金迄今為止已獲授權(quán)發(fā)明專利18篇,我們始終相信科技創(chuàng)新是企業(yè)發(fā)展的原動力。未來我們將繼續(xù)秉持“品質(zhì)高于一切,精品服務(wù)科研”的理念,為客戶提供高品質(zhì)產(chǎn)品,助力科研,與客戶一起共同成長。


ER501: TransZol Up Plus RNA Kit

產(chǎn)品說明

 本試劑盒適用于從細胞和組織中提取總RNA,用TransZol Up裂解樣品,加入氯仿后,溶液分為無色水相和粉紅色有機相,RNA在水相中;用硅膠膜離心柱特異吸附水相中的RNA,與其它總RNA提取方法相比,既具有TransZol Up裂解能力強、提取量高,應用范圍廣的優(yōu)點,又具有離心柱提取RNA純度高的優(yōu)點。

特點

 (1)應用范圍廣:動物、植物組織、病毒和細菌等樣品。小量樣品(50-100 mg組織、5×106 細胞、200 μl血液)。大量樣品( ≥1 g 組織或≥107細胞),離心柱的最大吸附量為100 μg。

 (2)裂解能力強:裂解充分、速度快,提取量高。

 (3)提取速度快:一個小時內(nèi)即可完成。

 (4)操作可視化:溶液呈粉紅色,便于分離水相。

 (5)提取純度高:DNA和蛋白質(zhì)的污染低。


EC501: MagicPure? RNA Beads

特點

 操作簡便,適用于自動化工作站。

與競品的比較 

分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對不同輸入量的人總RNA進行純化,使用Qubit對純化前后的RNA進行濃度測定,來確定RNA Beads的回收率。結(jié)果表明,不同RNA Beads的回收率無明顯差異。


與競品純化回收率比較


KP601: TransNGS? II Stranded RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina?

特點

 (1)高文庫轉(zhuǎn)化率。

 (2)高數(shù)據(jù)質(zhì)量。

適用范圍

 (1)全轉(zhuǎn)錄組測序。

 (2)基因表達分析。

 (3)單核苷酸變異分析。

 (4)可變剪切檢測。

 (5)融合基因檢測。

 (6)非編碼RNA和RNA前體分析。









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